律师解答：
申请人的主体资格范围不同：食品企业申请人是企业法人、合伙企业、个人独资企业、个体工商户等均可，小作坊只可以是个体工商户；申请许可的食品类别不同：食品企业可申请食品类别28类，小作坊申请类别19类，且具体类别也不尽相同
【法律依据】：
《中华人民共和全生产法》 第四条 生产经营单位必须遵守本法和其他有关安全生产的法律、法规，加强安全生产管理，建立、健全安全生产责任制和安全生产规章制度，改善安全生产条件，推进安全生产标准化建设，提高安全生产水平，确保安全生产。
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